<- haven::read_sav("data/coorte-t1-t2-24-08-17.sav")
dados_raw
<- dados_raw |>
dados_limpos ::clean_names() |>
janitor::filter(perdas == 1 &
dplyr== 0 & mania_t1 == 0) |>
hipo_t1 ::select(
dplyr
rec,# Identificador de cada participante
bipolar_conferido,# Diagnóstico de transtorno bipolar no tempo 2 - desfecho
sexo_t1,# Sexo
cpele_t1,# Cor da pele
abep3_t1,# Nível socioeconômico (ABEP)
escol_t1,# Escolaridade
trabatu_t1,# Trabalha atualmente
estano_t1,# Estuda no ano de avaliação
cinto_t1,# Usa cinto
capecet_t1,# Capacete
siverm_t1,# Sinal vermelho
dirigibb_t1,# Dirigir bêbado
acidente_t1,# Acidente
agress_t1,# Agressão
afogof_t1,# Familiar com arma de fogo
abranca_t1,# Arma branca
afogo_t1,# Arma de fogo
::matches("^srq\\d{1,2}_t1$"),
dplyr# Itens da SRQ
cons_t1,# Já consultou
hospner_t1,# Hospitalizado por nervos
medic_t1,# Medicação
smae_t1,# Mãe sofreu de nervos
spai_t1,# Pai sofreu de nervos
savo_t1,# Avós sofreram de nervos
sirmao_t1,# Irmãos sofreram de nervos
sfilho_t1,# Filhos sofreram de nervos
::matches("^bsi[1-5]_t1$"),
dplyr# Itens de 1 a 5 da BSI
::matches("^hcl[2-3].*_t1$"),
dplyr# Item 2 e itens da parte 3 da HCL-32
::matches("^bdi.*$"),
dplyr# Itens da BDI
::matches("^qlusou[c-j]1*_t1$"),
dplyr# Uso ao longo da vida de substâncias ilícitas
tabaco2_t1,# Sugestivo de abuso/dependência de tabaco
alcool_t1,# Sugestivo de abuso/dependência de álcool
forcsex_t1,# Sexo forçado
::matches("^ctq.*$"),
dplyr# Itens da CTQ
edmat_t1,# Episódio depressivo atual - baseline
rsat_t1,# Risco de suicídio - baseline
agoraat_t1,# Agorafobia - baseline
pansfo_t1,# Pânico sem fobia - baseline
pancfo_t1,# Pânico com fobia - baseline
agospan_t1,# Agorafobia sem pânico - baseline
fobsoa_t1,# Fobia social - baseline
tocat_t1,# TOC - baseline
tagat_t1,# TAG - baseline
# TEPT - baseline
teptat_t1 |>
) ::mutate(
dplyr::across(dplyr::matches("^ctq.*$"),
dplyras.numeric(x))
\(x)
)
# Os dados foram exportados em formato sav para manter os labels originais
# das variáveis e dos valores de cada categoria
|>
dados_limpos ::write_sav("data/latent_bipolar_data_2023_08_24.sav") haven
Limpeza de dados para projeto de transtorno bipolar latente
O presente documento descreve os passos de limpeza e processamento dos dados para o projeto de transtorno bipolar latente.
Importação, limpeza e exportação dos dados
Os dados foram importados a partir de um arquivo chamado coorte-t1-t2-24-08-17.sav
na pasta data
na raíz do projeto do RStudio. A função read_sav
do pacote haven
foi utilizada para carregar os dados brutos. Na sequência, os nomes das variáveis foram limpos através da função clean_names
do pacote janitor
. As observações do dataset foram filtradas para manter apenas os sujeitos que foram reavaliados na segunda onda do estudo, e também não apresentaram histórico de mania ou hipomania na primeira avaliação, levando em conta que o objetivo do estudo é explorar os casos incidentes de transtorno bipolar. Isso se dá por uma limitação na coleta de dados da primeira onda. Os participantes não eram perguntados sobre história de depressão na vida caso não fechassem critérios para episódio depressivo atual na entrevista diagnóstica. Após, as variáveis de interesse para o estudo juntamente com o desfecho foram selecionadas por meio da função select
do pacote dplyr
. A variável rec
trata-se do identificador de cada uma das observações. Os itens da CTQ foram transformados em numérico pois estavam originalmente em formato de caractere (string). O processo foi realizado com a função as.numeric
, aplicada através da função mutate
do pacote dplyr
em conjunto com a função across
para iterar por cada item do instrumento.
Ao final os dados foram exportados em formato .sav
do SPSS para facilitar o acesso aos rótulos tanto das variáveis quanto de suas categorias.
Como ficaram os dados após os filtros?
|>
dados_limpos ::glimpse() dplyr
Rows: 1,091
Columns: 154
$ rec <dbl> 163, 1322, 1123, 320, 414, 210, 1092, 161, 25, 77, 1…
$ bipolar_conferido <dbl+lbl> 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, …
$ sexo_t1 <dbl+lbl> 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 1, 2, 2, 2, …
$ cpele_t1 <dbl+lbl> 3, 1, 1, 2, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 3, 2, 2, 1, 1, …
$ abep3_t1 <dbl+lbl> 3, 2, 2, 2, 3, 1, 1, 1, 2, 2, 3, 3, 2, 2, 3, 3, …
$ escol_t1 <dbl+lbl> 1, 2, 1, 1, 1, 1, 2, 2, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, …
$ trabatu_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 1, NA, 0, NA, 1, NA, NA, NA, 1, NA, …
$ estano_t1 <dbl+lbl> 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, …
$ cinto_t1 <dbl+lbl> 1, 5, 5, 6, 6, 5, 6, 5, 6, 1, 1, 1, 5, 3, 6, 1, …
$ capecet_t1 <dbl+lbl> 1, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 3, 1, 6, 1, 6, 6, 6, …
$ siverm_t1 <dbl+lbl> 0, NA, NA, 1, NA, 0, 1, 0, 0, 0, NA, 0, …
$ dirigibb_t1 <dbl+lbl> 1, 2, 2, 3, 6, 2, 3, 3, 2, 3, 1, 2, 1, 2, 2, 2, …
$ acidente_t1 <dbl+lbl> 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, …
$ agress_t1 <dbl+lbl> 1, 1, 1, 1, 1, 1, 2, 1, 1, 2, 1, 3, 1, 2, 1, 1, …
$ afogof_t1 <dbl+lbl> 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, …
$ abranca_t1 <dbl+lbl> 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 2, 1, 1, 1, 1, 1, 1, …
$ afogo_t1 <dbl+lbl> 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, …
$ srq1_t1 <dbl+lbl> 1, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, …
$ srq2_t1 <dbl+lbl> 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, …
$ srq3_t1 <dbl+lbl> 0, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 1, …
$ srq4_t1 <dbl+lbl> 1, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, …
$ srq5_t1 <dbl+lbl> 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, …
$ srq6_t1 <dbl+lbl> 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, …
$ srq7_t1 <dbl+lbl> 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, …
$ srq8_t1 <dbl+lbl> 1, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, …
$ srq9_t1 <dbl+lbl> 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, …
$ srq10_t1 <dbl+lbl> 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, …
$ srq11_t1 <dbl+lbl> 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 1, …
$ srq12_t1 <dbl+lbl> 1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, …
$ srq13_t1 <dbl+lbl> 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, …
$ srq14_t1 <dbl+lbl> 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, …
$ srq15_t1 <dbl+lbl> 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, …
$ srq16_t1 <dbl+lbl> 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, …
$ srq17_t1 <dbl+lbl> 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, …
$ srq18_t1 <dbl+lbl> 1, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, …
$ srq19_t1 <dbl+lbl> 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, …
$ srq20_t1 <dbl+lbl> 1, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, …
$ cons_t1 <dbl+lbl> 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, …
$ hospner_t1 <dbl+lbl> 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, …
$ medic_t1 <dbl+lbl> 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, …
$ smae_t1 <dbl+lbl> 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, …
$ spai_t1 <dbl+lbl> 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, NA, 0, 0, …
$ savo_t1 <dbl+lbl> 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, NA, 0, 0, …
$ sirmao_t1 <dbl+lbl> 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, NA, 0, 0, …
$ sfilho_t1 <dbl+lbl> 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, NA, 0, 0, …
$ bsi1_t1 <dbl> 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1…
$ bsi2_t1 <dbl> 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2…
$ bsi3_t1 <dbl> 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2…
$ bsi4_t1 <dbl> 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2…
$ bsi5_t1 <dbl> 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1…
$ hcl2_t1 <dbl+lbl> NA, 1, 4, NA, 4, NA, 3, NA, NA, NA, 3, NA, …
$ hcl31_t1 <dbl+lbl> NA, 1, 0, NA, 1, NA, 0, NA, NA, NA, 1, NA, …
$ hcl32_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 1, NA, 1, NA, 0, NA, NA, NA, 1, NA, …
$ hcl33_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 1, NA, 1, NA, 1, NA, NA, NA, 1, NA, …
$ hcl34_t1 <dbl+lbl> NA, NA, 1, NA, 1, NA, 1, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl35_t1 <dbl+lbl> NA, 1, 1, NA, 0, NA, 1, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl36_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 0, NA, 0, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl37_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 0, NA, 0, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl38_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 0, NA, 1, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl39_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 1, NA, 0, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl310_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 1, NA, 1, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl311_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 1, NA, 0, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl312_t1 <dbl+lbl> NA, 1, 1, NA, 1, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl313_t1 <dbl+lbl> NA, 1, 1, NA, 1, NA, 1, NA, NA, NA, 1, NA, …
$ hcl314_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 0, NA, 0, NA, 1, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl315_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 1, NA, 1, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl316_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 1, NA, 0, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl317_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 1, NA, 0, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl318_t1 <dbl+lbl> NA, 1, 1, NA, 1, NA, 1, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl319_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 1, NA, 1, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl320_t1 <dbl+lbl> NA, 1, 1, NA, 1, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl321_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 1, NA, 0, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl322_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 1, NA, 1, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl323_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 0, NA, 1, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl324_t1 <dbl+lbl> NA, 1, 1, NA, 1, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl325_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 1, NA, 1, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl326_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 0, NA, 1, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl327_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 0, NA, 0, NA, 1, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl328_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 1, NA, 1, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl329_t1 <dbl+lbl> NA, 1, 0, NA, 0, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ hcl330_t1 <dbl+lbl> NA, 1, 1, NA, 1, NA, 1, NA, NA, NA, 1, NA, …
$ hcl331_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 0, NA, 1, NA, 1, NA, NA, NA, 1, NA, …
$ hcl332_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 0, NA, 0, NA, 0, NA, NA, NA, 0, NA, …
$ bdi1_t1 <dbl> 0, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2…
$ bdi2_t1 <dbl> 1, 2, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0…
$ bdi3_t1 <dbl> 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0…
$ bdi4_t1 <dbl> 1, 2, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1…
$ bdi5_t1 <dbl> 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 0…
$ bdi6_t1 <dbl> 0, 3, 0, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0…
$ bdi7_t1 <dbl> 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 1…
$ bdi8_t1 <dbl> 0, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 1…
$ bdi9_t1 <dbl> 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1…
$ bdi10_t1 <dbl> 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1…
$ bdi11_t1 <dbl> 1, 1, 1, 2, 0, 0, 3, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 1…
$ bdi12_t1 <dbl> 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2…
$ bdi13_t1 <dbl> 0, 1, 1, 2, 0, 2, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 2…
$ bdi14_t1 <dbl> 0, 2, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 2, 0, 0, 2, 0, 3…
$ bdi15_t1 <dbl> 0, 2, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0…
$ bdi16_t1 <dbl> 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 1…
$ bdi17_t1 <dbl> 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1…
$ bdi18_t1 <dbl> 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1…
$ bdi19_t1 <dbl> 0, 2, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1…
$ bdi20_t1 <dbl> 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1…
$ bdi21_t1 <dbl> 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0…
$ qlusouc_t1 <dbl+lbl> 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, …
$ qlusoud_t1 <dbl+lbl> 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, …
$ qlusoud1_t1 <dbl+lbl> 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, …
$ qlusoue_t1 <dbl+lbl> 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, …
$ qlusouf_t1 <dbl+lbl> 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, …
$ qlusoug_t1 <dbl+lbl> 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, …
$ qlusouh_t1 <dbl+lbl> 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, …
$ qlusoui_t1 <dbl+lbl> 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, …
$ qlusouj_t1 <dbl+lbl> 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, …
$ tabaco2_t1 <dbl+lbl> 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, …
$ alcool_t1 <dbl> 0, 2, 6, 6, 12, 2, 0, 7, 0, 13, 7, 8, 1, 8, 0, 12, 3…
$ forcsex_t1 <dbl+lbl> NA, 0, 0, NA, NA, NA, 0, NA, NA, NA, 0, 0, …
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